MIRDEP

I micro RNA (miRNA) sono acidi nucleici a singolo filamento costituite da circa 16-22 nucleotidi localizzati in modo ubiquitario all’interno del genoma. La loro funzione principale è quella di regolare l’espressione genica a livello post-trascrizionale legandosi a specifiche sequenze nelle regioni al 3'UTR del mRNA, e promuovendone la degradazione oppure sequestrandolo in specifici compartimenti subcellulari. Vengono trascritti da specifici geni, ma non tradotti in proteina.

Alcune funzioni che sono state associate alla presenza dei miRNA sono: sviluppo embrionale e cellulare, differenziazione cellulare, proliferazione e morte cellulare.

Il progetto di ricerca MIRDEP si propone di studiare i profili miRNA in pazienti affetti da sindrome depressiva su campioni di sangue venoso (possibilmente arricchiti nella componente piastrinica) arruolati dal gruppo del prof. Massimo Cocchi e del dr. Riccardo Simoni. In base a specifici criteri di inclusione/esclusione (al fine di ridurre la variabilità non dovuta alla patologia depressiva), i pazienti verranno suddivisi in tre sottogruppi: controllo (C), casi affetti da depressione minore (DMI) e casi affetti da depressione maggiore (DMA). I campioni di sangue raccolti dal gruppo del prof. Massimo Cocchi dovranno essere arricchiti nella componente piastrinica e crioconservati a -80°C, pronti per essere spediti in ghiaccio secco presso la sede operativa lombarda (Parco Tecnologico Padano) di NEXT Genomics. In questa sede i campioni verranno sottoposti a sequenziamento profondo (“deep sequencing”) all’interno della piattaforma GenHome di Lodi.

Le analisi effettuate sui campioni di sangue di pazienti affetti da sindrome depressiva permetteranno di scoprire quattro nuovi gruppi di miRNA, mai identificati in lavori precedenti, che si saranno dimostrati statisticamente diversi nella loro espressione in contrasto fra i gruppi analizzati (C vs DMI+DMA; C vs DMI; C vs DMA; DMI vs DMA). Successivamente verranno effettuate delle ricerche in banca dati (NCBI) per l’identificazione dei possibili geni target dei “novel miRNA” identificati nei quattro gruppi.